En una primera etapa, el IDH ha centrado sus esfuerzos en el Área de Salud, mediante el Programa SidAcción, a través de sus subprogramas de Prevención, Atención Integral en Salud,  Derechos Humanos e Incidencia Política, contribuyendo significativamente a generar y fortalecer las respuestas a la epidemia del sida en Bolivia, tanto en educación preventiva, como en atención en salud y respeto a los derechos de las personas con VIH.

A partir de 2010, el IDH desarrolla los programas MediAcción y EcoAcción,  áreas que se desenvuelven respectivamente en defensa de los derechos humanos y la protección del medio ambiente.